Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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CCINQ13939 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CCINQ13939 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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