Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms