Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms