Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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