Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXO1Q12778 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms