Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPREP23469 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPREP23469 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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