Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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