Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXB4P17483 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms