Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U3KQE9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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U3KQE9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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U3KQE9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U3KQE9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U3KQE9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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