Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms