Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms