Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms