Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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