Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf78Q9NZ63 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms