Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms