Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00846Q9NV44 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms