Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms