Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C11orf49Q9H6J7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms