Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms