Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms