Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP88Q99567 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms