Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms