Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms