Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms