Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms