Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms