Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXZ3

SP8, Transcription factor Sp8, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP8Q8IXZ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP8Q8IXZ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms