Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms