Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRINP3Q76B58 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRINP3Q76B58 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms