Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms