Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms