Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms