Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms