Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BFSP2Q13515 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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