Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TRAF3Q13114 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TRAF3Q13114 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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