Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TROQ12816 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TROQ12816 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TROQ12816 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TROQ12816 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
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