Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms