Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSRP1Q08945 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms