Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRAP54198 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRAP54198 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIRAP54198 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIRAP54198 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIRAP54198 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRAP54198 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRAP54198 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms