Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC3P51654 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC3P51654 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC3P51654 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC3P51654 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC3P51654 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC3P51654 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC3P51654 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC3P51654 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC3P51654 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms