Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBRP36941 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBRP36941 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBRP36941 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms