Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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