Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
COX5BP10606 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX5BP10606 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX5BP10606 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX5BP10606 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX5BP10606 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms