Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI2P10070 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI2P10070 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI2P10070 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI2P10070 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI2P10070 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI2P10070 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLI2P10070 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLI2P10070 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLI2P10070 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI2P10070 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI2P10070 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI2P10070 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms