Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms