Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRCP08575 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCP08575 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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