Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms