Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms