Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPLO60437 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPLO60437 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PPLO60437 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PPLO60437 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPLO60437 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPLO60437 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPLO60437 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms