Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLGNO14967 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLGNO14967 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLGNO14967 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLGNO14967 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLGNO14967 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLGNO14967 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms